1、分離效能高：由于新型高效微粒固定相填料的使用，液相色譜填充柱的注銷可達 5×10 3 ～3×10 4 塊/m 理論塔板數(shù)，遠遠高于氣相色譜填充柱 10 3 塊/m 理論塔板數(shù)的柱效。 

2、選擇性高：由于液相色譜柱具有高柱，并且流動相可以控制和改善分離過程的選擇性。因此，高效液相色譜儀不僅可以分析不同類型的有機化合物及其同分異構(gòu)體，還可以分析在性質(zhì)上極為相似的旋光異構(gòu)體，并已在高療效的合成藥物和升華藥物的生產(chǎn)控制分析中發(fā)揮了重要作用。 

3、檢測靈敏度高：在高效液相色譜儀中使用的檢測器大多數(shù)都具有較高的靈敏度。如被廣泛使用的紫外吸收檢測器，最小檢出量可達 10 9 g，用于痕量分析的熒光檢測器，最小檢出量可達 10 -12 g。 

4、分析速度快：:由于高壓輸液泵的使用，相對于經(jīng)典液相色譜，其分析時間大大縮短，當輸液壓力增加時，流動相流速會加快，完成一個樣品的分析時間僅需幾分鐘到幾十分鐘。